Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms