Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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