Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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