Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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DDX39BQ13838 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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