Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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SHROOM2Q13796 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SHROOM2Q13796 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SHROOM2Q13796 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
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