Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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TOP3AQ13472 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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TOP3AQ13472 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TOP3AQ13472 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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