Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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LSAMPQ13449 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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LSAMPQ13449 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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LSAMPQ13449 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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LSAMPQ13449 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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LSAMPQ13449 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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LSAMPQ13449 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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LSAMPQ13449 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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LSAMPQ13449 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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LSAMPQ13449 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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LSAMPQ13449 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LSAMPQ13449 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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