Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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