Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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