Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms