Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NFX1Q12986 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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