Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TRAF2Q12933 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TRAF2Q12933 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TRAF2Q12933 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TRAF2Q12933 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TRAF2Q12933 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TRAF2Q12933 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TRAF2Q12933 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TRAF2Q12933 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TRAF2Q12933 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF2Q12933 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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