Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms