Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.8 ms