Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms