Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPCQ03188 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms