Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCNT1Q02742 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms