Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NHLH2Q02577 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms