Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CENPEQ02224 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms