Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms