Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms