Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
EEF1A1P68104 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms