Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKAA2P54646 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKAA2P54646 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms