Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NESP48681 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NESP48681 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NESP48681 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NESP48681 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NESP48681 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NESP48681 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms