Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LTBRP36941 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LTBRP36941 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms