Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT1P21579 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT1P21579 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT1P21579 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT1P21579 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT1P21579 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT1P21579 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT1P21579 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT1P21579 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT1P21579 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT1P21579 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT1P21579 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT1P21579 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT1P21579 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT1P21579 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT1P21579 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms