Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFE3P19532 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TFE3P19532 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TFE3P19532 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TFE3P19532 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TFE3P19532 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TFE3P19532 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFE3P19532 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms