Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSPAN8P19075 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSPAN8P19075 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSPAN8P19075 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms