Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DESP17661 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DESP17661 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DESP17661 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DESP17661 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DESP17661 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DESP17661 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DESP17661 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DESP17661 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms