Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT10P13645 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT10P13645 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT10P13645 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT10P13645 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT10P13645 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT10P13645 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT10P13645 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT10P13645 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT10P13645 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT10P13645 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT10P13645 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT10P13645 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT10P13645 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT10P13645 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms