Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD8P13378 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms