Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
GZMBP10144 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms