Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLA1P09884 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLA1P09884 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLA1P09884 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLA1P09884 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLA1P09884 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLA1P09884 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLA1P09884 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms