Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTPRCP08575 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTPRCP08575 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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