Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGAVP06756 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms