Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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ZBED1O96006 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED1O96006 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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