Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCTN3O75935 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCTN3O75935 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCTN3O75935 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DCTN3O75935 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCTN3O75935 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DCTN3O75935 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DCTN3O75935 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCTN3O75935 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DCTN3O75935 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
DCTN3O75935 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCTN3O75935 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCTN3O75935 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCTN3O75935 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DCTN3O75935 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCTN3O75935 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms