Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms