Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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