Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms