Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-1B6SEH8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms