Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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SOBPA7XYQ1 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SOBPA7XYQ1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SOBPA7XYQ1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SOBPA7XYQ1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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