Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C4orf47A7E2U8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms