Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPB15A6NHN6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms