Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms