Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms