Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC27A6Q9Y2P4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms