Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFR3BQ9Y2G0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFR3BQ9Y2G0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms