Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TRAPPC4Q9Y296 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms