Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms